حضرت آیت‌الله خامنه‌ای با تسلیت درگذشت آیت‌الله مصباح یزدی فرمودند: ایشان متفکری برجسته، مدیری شایسته، دارای زبان گویائی در اظهار حق و پای با استقامتی در صراط مستقیم بودند.